محسن اسماعیلی، معاون راهبردی و امور مجلس رئیس‌جمهور در یادداشتی در روزنامه ایران نوشت: برخی کتاب‌ها سرنوشت‌ساز هستند و بی‌شک «تنبیه ُالاُمَّة و تَنْزیه ُالمِلَّة» نوشته علامه نایینی در تاریخ ایران و تشیع در زمره این گونه کتاب‌هاست. شخصیت بسیار برجسته نویسنده، مکانت رفیع علمی و معنوی، زمان تدوین و انتشار، موضوع و اعتبار و غنای استدلال از جمله دلایل ماندگاری و تأثیرگذاری این کتاب است. او خود در مقدمه کوتاهی انگیزه تألیف این کتاب را بیان کرده است.
هر سال دو بار و به فاصله یک‌ماه حسرت فقدان دکتر داود فیرحی، استاد فقید دانشگاه تهران و تلاش فکری او که ناتمام ماند برای شاگردانش و اهالی علوم سیاسی ایران تازه می‌شود. یک‌بار در آغاز بازگشایی دانشگاه‌ها و راهروها و کلاس‌هایی که وجود او را کم دارد و بار دیگر در آبان که خاطره تلخ درگذشت نابهنگامش بار دیگر زنده می‌شود. او استادی با اخلاق و متواضع بود و یکی از معدود متفکرانی به شمار می‌آمد که میان نهاد دین و عرصه سیاست پلی علمی و عقلانی ساخت و با نگاهی ژرف و روش‌مند می‌کوشید نشان دهد می‌توان از درون سنت به گفت‌وگویی بازاندیشانه با دنیای جدید رسید، بی‌آنکه به دام تعصب گرفتار شد.
آیت الله حسین مظاهری در پیامی به همایش بزرگداشت علّامه محقّق نائینی، توجّه ایشان به مسائل سیاسی و اجتماعی مسلمانان، مقام والای معنوی و اخلاقی و ابعاد علمی و ویژگیِ اندیشه‌گی این علامه را درسی برای همگان بویژه طلاب دانست.